FROID

La collecte et le stockage des isolats cliniques permettent d’adapter les traitements et de suivre les tendances de virulence et de résistance aux antimicrobiens. La virulence correspond à la capacité d’une bactérie à provoquer une pathologie, envahir l’organisme et échapper au système immunitaire via des toxines, adhésines, capsules ou biofilms. La résistance repose sur des gènes codant pour la dégradation ou l’efflux des antibiotiques et peut être régulée par des mécanismes épigénétiques réversibles. Les données préliminaires de l'UMR6249 montrent que la congélation peut entraîner des pertes de résistance, comme observé pour la ceftazidime. Les modifications épigénétiques bactériennes, incluant la méthylation de l’ADN (m4C, m5C, m6A), modulent l’expression des gènes. Une collaboration entre l’UMR6249 et l’UMR1098 analyse l’impact de la congélation sur Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus et Escherichia coli. Des tests de virulence et de résistance seront réalisés avant et après congélation, associés à des analyses épigénétiques par technologie Oxford Nanopore et transcriptomiques afin de comprendre les mécanismes impliqués et leurs implications cliniques. Ce projet permettra, pour la première fois, de caractériser la perte de résistance aux antibiotiques et de virulence des souches pathogènes après congélation.