Découvrir la microbiologie en Bourgogne-Franche-Comté
Visites de laboratoires pour étudiants de Licence
Pour faire découvrir la diversité de disciplines en microbiologie aux étudiants de Bourgogne-Franche-Comté, HARMI organise des visites de laboratoires par des chercheurs et des responsables de plateformes.
Pour proposer un atelier d’une heure pour des étudiants de Licence, contacter harmi(at)umlp.fr
| Unité de Recherche | Responsable(s) | Domaine | Thématique | Nombre d'étudiants |
|---|---|---|---|---|
| Agroécologie | Clémence Thiour-Mauprivez | Microbiologie environnementale | Microplastiques et bactéries du sol. | 5 |
| Biogéosciences | Anne-Lise Santoni | Géomicrobiologie | Spectrométrie de masse de rapport isotopique pour l'analyse de la matière organique. | 1 |
| Biogéosciences | Pierre Pellenard, Ludovic Bruno | Géomicrobiologie | Analyse d'échantillons naturelles (roches sédimentaires), par DRX (diffraction par Rayonnement X) et WDXRF (analyse chimique par Rayonnement X), appliqué à la recherche et aux besoins de la Géotechnique. | 2 |
| CSGA | Loic Briand | Microbiologie alimentaire | Production hétérologue de protéines sucrées avec la levure Pichia Pastoris. La brazzéine est une petite protéine au goût sucré, stable à la chaleur et au pH, isolée de la plante ouest-africaine Pendadiplandra brazzeana. | 5 |
| PAM | Raphaëlle Tourdot-Maréchal | Microbiologie alimentaire | Compréhension des processus d'adaptation des micro-organismes, allant de l’échelle moléculaire à une intégration des phénomènes d’interactions avec l’environnement, la matrice, l’hôte et/ou avec d’autres micro-organismes. | 1 |
| PAM | Sandrine Rousseaux | Microbiologie alimentaire | Comprendre l’activité des microorganismes au sein des écosystèmes et leurs interactions avec d’autres micro-organismes. | 6 |
| PAM | Thi Kim Chi Nguyen | Microbiologie alimentaire | L'interaction entre les microorganismes et leurs environnements dans le cadre des matrices alimentaires avec l'objectif de maitriser la fermentation et de développer de nouveaux levains assurant la qualité organoleptique et sanitaire des produits. | 2 |
| Chrono-environnement/CHUB | Catherine Llanes | Microbiologie santé | Le laboratoire chrono-environnement étudie les mécanismes développés par les bactéries pour résister aux antibiotiques, mais aussi aux huiles essentielles voire même à leurs ennemis naturels, les bactériophages. | 7 |
Gratifications de stages Masters et Licences
HARMI finance chaque année des gratifications de stages pour des étudiants en L3, Master 1 et Master 2 effectuant leur stage dans un des laboratoires partenaires en Bourgogne Franche-Comté.
Procédure :
Stages de Master : les chercheurs communiquent les sujets de stage aux Directeurs d’Unité qui transmettent la liste à HARMI avec pour chaque demande : le sujets de stage, le(s) encadrant(s) et la durée du stage. Les sujets de stage sont ensuite examinés par le MMT (Management et Monitoring Team) d'HARMI.
Date limite pour transmettre à HARMI la liste des stages de Master pour l'année 2026-2027 (Directeurs d'Unité) : avant le 15 octobre 2026
Stages de Licence (1 à 4 mois de stage) : les chercheurs communiquent leur demande directement à HARMI au fil de l’eau (sujet du stage, encadrant(s), durée et période du stage) à harmi@umlp.fr. Les sujets des stages sont examinés et validés par le MMT.
Le projet HARMI financera en 2026-2027 des gratifications de stages de Master sur sa ligne Formation dédiée (donc hors projets de recherche HARMI). Pour en bénéficier, les DUs pourront nous transmettre la liste des sujets de stages de l’unité en lien avec HARMI (microbiologie environnementale, microbiologie alimentaire, interaction hôte-microbiome, biotechnologie microbienne), incluant :
- le sujet du stage
- le(s) encadrant(s)
- la durée du stage.
Les futurs stagiaires pourront provenir d'établissements extérieurs au site Bourgogne Franche-Comté.
Modalités :
- Transmission à l'adresse harmi@umlp.fr avant le 15 octobre 2026. Nous vous communiquerons ensuite la liste des stages retenus pour financement par HARMI.
- Cas des stages nécessitant une validation de leur financement avant l'été : possibilité de remonter une première liste de sujets de stage avant fin juin 2026 pour un premier arbitrage par le MMT HARMI. Une seconde liste de l'unité pourra être transmise avant le 15 octobre 2026.
IMPORTANT : la présente demande ne concerne pas les stages dont le financement par HARMI est déjà prévu sur les projets de recherche (projets lauréats des AAP1/AAP2 HARMI et des appels Région Structuration TRANSBIO 2025 et 2026). Comme ces stages ont déjà un financement acquis, il ne faut pas les remonter pour éviter les doublons dans les allocations de financement HARMI.
Rappel Stages de Licence : le projet HARMI finance également les stages de Licence dans ses thématiques. Modalités :
- demandes examinées au fil de l’eau,
- transmission des informations sur le stage à harmi@umlp.fr au plus tard 1 mois avant le début du stage.
Invitations de Masters et Licences à des manifestations scientifiques
Les étudiants de Licence et de Master sont régulièrement invités aux manifestations scientifiques, telles que les symposia HARMI et les évènements financés par l’AAP séminaires/workshops/summer schools annuel.
Cours spécialisés d’experts internationaux
HARMI promeut la diffusion de cours d’experts internationaux permettant de découvrir différentes disciplines et thématiques en microbiologie. Ces interventions, en visioconférence et d’une durée d’une heure, sont organisées alternativement par les différents Masters HARMI et sont ouvertes à tous les étudiants et personnels des établissements partenaires en Bourgogne-Franche-Comté.
Cours donnés en 2026 :
Julie Jean (Université Laval, Québec)
Food virology and beyond: research and training opportunities at Université Laval
30/06/2026
Zacchary Blount (Michigan State University)
Long-term evolution experiment (LTEE) in bacteria
16/01/2026
Guilhem Faure (Broad Institute of MIT and Harvard)
Nature programmable tools: CRISPR, its derivatives and beyond
15/10/2025
