L’objectif du pilier 3 d’HARMI est d’accroître le développement et l’ouverture des plateformes technologiques du périmètre HARMI du site Bourgogne-Franche-Comté pour développer les interactions scientifiques à différentes échelles, favoriser les transferts de technologies et accroitre l’attractivité de la région Bourgogne-Franche-Comté.
Objectifs
Réseau de plateformes
Harmi a pour objectif de construire et renforcer l’innovation technologique et la prestation de service autour de neuf plateformes technologiques.
Co-financement de gros équipements
HARMI peut proposer le co-financement d’équipements de pointe au sein de ses neuf plateformes partenaires dans le cadre des appels à projets « Plateformes de Recherche » de la Région Bourgogne-Franche-Comté.
Le projet a ainsi cofinancé l’achat d’un Microscope Electronique à Balayage Ultra Haute Résolution Tescan pour la plateforme DImaCell dans le cadre de l’appel à projet de 2022. Le microscope a été installé à la plateforme en 2024.
Soutien de la politique qualité des plateformes
Une ingénieure qualiticienne, Maëlle Deshoux, a été recrutée à temps plein par l’Université-Bourgogne-Europe avec des fonds HARMI afin d’accompagner les neuf plateformes HARMI dans l’amélioration du niveau de qualité, l’identification des besoins et l’homogénéisation des bonnes pratiques, ainsi que pour les appuyer dans les démarches de certification. Elle participe à la mise en réseau des plateformes du périmètre HARMI.
Collections microbiennes
Les collections de micro-organismes hébergées par les laboratoires du périmètre HARMI sont une formidable richesse, à la fois pour étudier leur diversité et leurs fonctions, mais aussi pour envisager de pouvoir les utiliser dans différents procédés industriels pour développer des solutions innovantes fondées sur la nature.
Liste des collections microbiennes
Collection (Lieu) | Description | Contact |
CRB-FMB : Centre de Ressource Biologique - Filière Microbiologique (CHU de Besançon Franche-Comté) | Le CRB-FMB est la biobanque microbienne du CHU de Besançon Franche-Comté. Ce CRB est certifié selon les normes ISO 9001 et ISO 20387. Ses collections comprennent environ 100 000 souches et leurs données associées (pathologies associées, phénotype, génotype). Le CRB-FMB collecte notamment des bactéries multirésistantes aux antibiotiques, des micro-organismes responsables de bactériémies ou d’infections ostéoarticulaires, des levures et champignonsfilamenteux. Un catalogue référence les principales collections de bactéries. | |
MIAE : Microorganismes d'Intérêt pour l'Agriculture et l'Environnement (UMR INRAE Agroécologie, Dijon) | La collection MIAE (Microorganismes d'Intérêt pour l'Agriculture et l'Environnement) comprend plus de 10 000 souches microbiennes d'origine tellurique appartenant à 48 genres de champignons et oomycètes et 13 genres de bactéries. Ces micro-organismes ont été isolés par des méthodes pasteuriennes pendant 30 années de recherches scientifiques liées au fonctionnement du sol. L'identification fongique et bactérienne est basée sur les propriétés chimiotaxonomiques et /ou métaboliques et sur l'utilisation d'outils moléculaires appropriés. MIAE a pour ambition d’être certifié ISO 9001 courant 2027. | |
IBG : The International Bank for the Glomeromycota (UMR INRAE Agroécologie, Dijon) | L’IBG est une structure dédiée à la conservation de la biodiversité des champignons mycorhiziens à arbuscules et l'enregistrement des isolats bien définis dans une base de données internationale accréditée ISO 9001. L'IBG à Dijon maintient un réservoir de base du matériel génétique de la diversité fongique (45 adhésions / 250 cultures) sur les plantes hôtes et fournit des cultures de référence aux chercheurs. Des formations techniques sont organisées sur demande pour les utilisateurs. | |
Collection de l’UMR Chrono-environnement/thème pollution (UMR Chrono-environnement, Montbéliard) | La collection du thème pollution de l’UMR Chrono-environnement inclut des souches fongiques et bactériennes ayant une fonction reconnue en bioremédiation. | |
AARC : Aspergillus Azole Resistance Collection (CHU de Besançon Franche-Comté) | L’AARC est une collection de souches du champignonAspergillus fumigatus isolées de prélèvements cliniques et environnementaux et présentant ou non une résistance aux antifongiques/fongicides azolés. | |
Collection de la plateforme INRAE FROMEX/UMR PAM (équipe AFIM) (Plateforme FROMEX, Poligny) | La collection de la plateforme FROMEX compte 2000 souches de bactéries isolées à partie de lait et de fromage, utilisées spécifiquement en fabrication fromagère. |
Soutien au développement qualité des collections microbiennes
Une ingénieur qualité collections, Chahrazade Abouelaz, a été recrutée à temps plein par l’Université Marie et Louis Pasteur (UMLP) avec des fonds HARMI pour accompagner le développement et la structuration des collections microbiennes des laboratoires partenaires d’HARMI dans l’amélioration de la qualité, l’identification des besoins et l’homogénéisation des bonnes pratiques. Elle participe à la mise en réseau des collections du périmètre HARMI.
