Nouvelles toutes fraîches (c’est appréciable) pour cette deuxième newsletter HARMI. Vous retrouverez les évènements et actions en cours, les lauréats de financements variés et les appels à propositions pour soutenir les actions de recherche et de formation en microbiologie en Bourgogne-Franche-Comté. En supplément dans cette édition, les questions-réponses sur l’AAP3 HARMI .
À LA UNE
Troisième tour de Manège
Rendez-vous à Dole au Manège de Brack pour le 3e symposium HARMI les 15 et 16 septembre 2026. L’année dernière, l’évènement avait rassemblé 234 participants, dont 135 chercheurs, 78 étudiants et des représentants de six entreprises.
Les conférences invitées seront données cette année par Marie Simonin (microbiotes des plantes), Karim Benzerara (géomicrobiologie) et Xavier Bellanger (antibiorésistance).
Programme du symposium 2026 bientôt disponible ici
Du champ à l’assiette
Lauréate d’un co-financement HARMI, la plateforme DImaCell a organisé la summer school Les 25èmes journées du RIME : « Du champ à l’assiette : la microscopie électronique pour imager les artisans de l’invisible, les cellules et les micro-organismes » à Dijon du 1er au 3 juin 2026. L’évènement a réuni 150 participants et 35 partenaires industriels (15 sociétés privées).
Un grand merci à tout le comité d’organisation pour ces trois formidables journées de présentations, de posters et de discussions, entre partenaires académiques et partenaires industriels, montrant le vaste champ d’action de la microscopie pour étudier les micro-organismes.
Pour bénéficier d’un financement HARMI pour l’organisation de séminaires/workshops/summer schools,
voir rubrique Appels à Propositions
Tarif réservé aux mobiles
Célien Durney est le 1er postdoctorant à bénéficier d’une bourse de mobilité HARMI de 2000 €. En postdoctorat à l’UMR Agroécologie, il sera accueilli pour environ 3 mois à l’université de Zürich pour travailler sur la caractérisation fonctionnelle des communautés bactériennes associées à différents champignons mycorhiziens à arbuscules, dont Rhizophagus irregularis, et leur impact sur la physiologie des plantes.
Pour bénéficier d’une bourse de mobilité internationale pour doctorants/postdoctorants
voir rubrique Appels à Propositions
Microbiologistes en devenir
Le Forum des Jeunes Chercheurs s’est tenu les 4 et 5 juin 2026à l’UFR des Sciences de Santé à Dijon. Rendez-vous scientifique annuel de l’École Doctorale Environnements-Santé, il permet aux doctorants de présenter leurs travaux, d’échanger autour de leurs thématiques de recherche et de favoriser l’émergence de collaborations interdisciplinaires.
HARMI a soutenu financièrement cette édition qui incluait une session HARMI dans son programme, constituée de conférences données par les doctorants du périmètre du projet. L’évènement a compté 4 présentations orales et 12 posters rentrant dans les thématiques du projet.
Sciences à domicile pour les Master
Organisée par le Master MP2, la conférence de Julie Jean (Université Laval, Québec) a eu lieu en visioconférence le 30 juin 2026.
Elle a présenté ses travaux sur les contaminations virales dans l’alimentation et a parlé des opportunités de formation au sein de son laboratoire. Partagée avec les chercheurs et étudiants du site Bourgogne-Franche-Comté, la conférence a compté une trentaine de participants.
C’est la 3e conférence d’experts internationaux pour Masters partagée avec la communauté HARMI en 2025-2026.
HARMI promeut la mise en réseau de ses 10 Masters partenaires(1) et l’internationalisation de la formation en microbiologie en encourageant l’organisation et la diffusion de cours spécialisés d’experts internationaux
(1) AMAQ, B2IPME, EMME, FORTHEM, GDE, MAGE, MB, MP2 , PFAA, SP2G
Je suis ton harmi
C’est au Biome (Besançon) que s’est tenue l’inauguration du premier livre de vulgarisation grand public HARMI le 18 juin 2026 : « Le journal de Chloé - Tome 1 : Les microbes, mes nouveaux BFF ».
Produit de la collaboration avec Claire Morel (autrice) et Charlotte Cornudet (illustratrice), cet ouvrage fera découvrir au jeune public le monde de la microbiologie à travers les aventures d’une adolescente.
Ce premier tome, généraliste, balaye cinq grands thèmes de nos unités : communautés microbiennes du sol, antibiorésistance, ferments alimentaires, géomicrobiologie et microbes en bioremédiation.
Le 2e tome, sur le thème de la fermentation, est en cours de préparation et sortira en 2027.
Le livre, édité aux Presses Universitaires de Franche-Comté (PUFC), est en vente ici.
Microbes de collections…
La journée des collections microbiennes partenaires d’HARMI, organisée par l’ingénieure qualité HARMI, Chahrazade Abouelaz, a eu lieu le jeudi 21 mai 2026à la Maison Pasteur à Dole.
Elle a réuni 13 personnels des différentes collections microbiennes du site Bourgogne-Franche-Comté : CRB-FMB (CHU de Besançon-Franche-Comté), MIAE champignon (UMR Agroécologie), IBG (UMR Agroécologie) , collection Pollution (UMR Chrono-environnement) et collection ferments microbiens (plateforme FROMEX).
Au programme des discussions : modèles de MTA (Material Transfer Agreement), protocole de Nagoya, collections miroirs et financements pour la gestion des données.
… et plateformes de qualité
La journée des plateformes partenaires d’HARMI, organisée par l’ingénieure qualité HARMI, Maëlle Deshoux, a eu lieu le lundi 29 juin 2026 à Dijon à l’UFR SVTE de l’Université Bourgogne Europe (bâtiment Gabriel).
Elle a réuni une quarantaine de personnels de 8 des 9 plateformes techniques HARMI du site Bourgogne-Franche-Comté : 2B2S, 4PMI, Biotech’Innov, DImaCell, DIVVA, FROMEX, Genosol, GISMO et PEA2t.
Cette première journée a permis à chaque plateforme de présenter ses activités et d’échanger sur les approches qualité (gestion documentaire, périmètres de certification ISO 9001…). La SATT SAYENS est intervenue sur les aspects Qualité.
Dernières publications
Tomko P; Ovando-Ovando CI; Boussagol P ; Santiago-Martínez MG; Visscher PT. Methanogens through time and space: impact on Earth’s planetary evolution and biogeochemistry. Geosciences 2026, 16 (14), p.144. https://dx.doi.org/10.3390/geosciences16040144
Boussagol, P.; Vennin, E.; Motreuil, S.; Bonnotte, A.; Jouve, G.; Millet, L.; Munier, T.; Visscher, P. T. Enhanced Carbonate Production Model for Temperate Stratified Lakes. Limnol. Oceanogr. 2026, 71 (2), e70334. https://doi.org/10.1002/lno.70334
Visscher, P. T.; Boussagol, P.; Bourillot, R.; Dupraz, C.; Braissant, O.; Decho, A. W.; Burns, B. P.; White III, R. A.; Tomko, P.; Vennin, E. A Critical Role of Heterotrophic Bacteria in Early Diagenesis of Carbo
Appel à projets: AAP3 HARMI
HARMI peut financer 6 projets starters, 3 projets transversaux, 3 projets internationaux et 3 projets industriels.
Propositions à envoyer jusqu’au 9 octobre 2026 à 13h
Détails et conditions sur la page web HARMI
Supplément : FAQ disponible ici !
Appel à propositions : Financements de séminaires/workshops/summer schools en 2026
HARMI peut financer 10 séminaires, 3 workshops et 2 summer schools en BFC jusqu’au 1er décembre 2026.
Propositions à envoyer au minimum 2 mois avant l’évènementet au plus tard le 1er octobre 2026.
Détails et conditions sur la page web HARMI
Appel à candidatures : Bourses pour des séjours scientifiques de doctorants/postdoctorants dans des laboratoires étrangers en 2026-2027
HARMI peut financer jusqu’à 5 bourses par an (2000€ maximum).
Propositions à envoyer avant le 1er octobre 2026pour des séjours entre décembre 2026 et avril 2027.
Détails et conditions sur la page web HARMI
Toute obtention d’un financement HARMI impose un engagement strict à mentionner dans les publications et les communications scientifiques le soutien et la référence du projet selon l’exemple :
“This research was funded by the HARMI (HARnessing MIcrobiomes for sustainable development) project (ANR-21-EXES-0014) under the France 2030 program managed by the ANR and funded by The European Union NextGenerationEU."
AGENDA HARMI
Septembre | |
Evènements | |
15-16/09 | 3e Symposium HARMI Lieu: Manège de Brack, Dole |
Deadlines | |
30/09 | Candidatures pour des bourses pour des séjours scientifiques de doctorants/postdoctorants dans des laboratoires étrangers entre décembre 2026 et avril 2027 |
| Propositions pour le financement de séminaires/workshops/summer schools en 2026 |
Octobre | |
Deadlines | |
09/10 | Propositions pour le financement de projets dans le cadre de l’AAP3 |
NOUS CONTACTER
Pour toute question, contacter harmi(at)umlp.fr
Page web HARMI https://www.umlp.fr/harmi
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Le projet HARMI est financé par le programme d’Etat France 2030 géré par l’ANR (référence ANR-21-EXES-0014)
