English version below
Le projet ANR France 2030 HARMI lance sa newsletter. Pour cette première édition, vous retrouverez les actions en cours, les lauréats de financements variés et les appels à propositions en cours pour soutenir les actions de recherche et de formation en microbiologie en Bourgogne Franche-Comté.
A LA UNE
On casse les murs entre unités
Pour l’AAP2 HARMI, 14 projets de recherches ont été retenus pour financement : 4 starters (DEVINE, FungiTasty, IDYLYK, STREAM), 5 transversaux (DERMABIOME, MICROBIOPLAST, MiTasteFly, RESCUE, THIOMINE), 4 internationaux (AMAZ-LIFE, ABRICO, DARWIN, ENVI-FUNGI-R) et 1 industriel (PRO-SIP). Ces projets interdisciplinaires et inter-unités de BFC (10 unités et 3 plateformes) couvrent les 4 work packages1 HARMI. A saluer, le travail des reviewers externes et des experts de l’International Advisory Board (IAB) pour l’évaluation et le classement des projets.
L’AAP1 avait vu 8 projetsfinancés en 2025 : 5 starters (ARMOR, BIORELAX, LALI-HDA, MICMET, PARADE), 1 transversal (IRONEX) et 2 internationaux (FUNGIPSOME, M-CARBO-STORE) soit 8 unités et 3 plateformes.
1 WP1. Comprendre l’écologie et la dynamique spatio-temporelle des communautés microbiennes; WP2. Déchiffrer les interactions microbiote-hôte; WP3. Gérer les communautés microbiennes pour améliorer la durabilité et la fourniture de services; WP4. Développer les biotechnologies microbiennes
Et c’est reparti pour un tour… l’AAP3 HARMI est lancé ! Voir rubrique « Appels à propositions »
Jeune chercheuse d'excellence.
Maria C. Hernandez-Soriano est la lauréate de la première chaire d’excellence jeunes chercheurs HARMI “Understanding and steering microbial communities in agroecosystems to enhance the delivery of ecosystem services”. Actuellement en postdoc au John Innes Centre (Norwich, UK), elle rejoindra l’UMR Agroécologie (INRAE Dijon) en novembre 2026.
Elle est venue fin avril visiter les locaux de l’INRAE Dijon et présenter ses travaux.
La sélection pour la 2e chaire d’excellence jeunes chercheurs HARMI à l’UFR Sciences de la Santé (UMLP) / UMR Chronoenvironnement à Besançon (Antibiorésistance) est en cours
Deux latitudes, deux thématiques.
Les doctorants Yoann Boisson (UMR Chrono-environnement) et Victor Hugonnot (UMR Biogéosciences) ont bénéficié d’une bourse de mobilité HARMI de 2000€ chacun pour effectuer un séjour dans un laboratoire à l’étranger. Yoann a été accueilli au Centre de Biotechnologie et de Génomique Végétale de Madrid pour 3 mois pour étudier l’effet de consortia fungiques sur le peuplier. Victor, lauréat d’une ½ bourse de thèse2 HARMI en 2025, a été accueilli pour 2 mois au Geological Survey of Norway à Trondheim pour étudier l’implication de l’activité microbienne dans l’oxygénation de la Terre sur des carottes sédimentaires.
2dans le cadre du dispositif PhD tracks de la graduate school TRANSBIO
Pour bénéficier aussi d’une bourse de mobilité (doctorants et postdoctorants), voir rubrique « Appels à Propositions »
Dernières publications
Boussagol, P.; Vennin, E.; Motreuil, S.; Bonnotte, A.; Jouve, G.; Millet, L.; Munier, T.; Visscher, P. T. Enhanced Carbonate Production Model for Temperate Stratified Lakes. Limnol. Oceanogr.2026, 71 (2), e70334. https://doi.org/10.1002/lno.70334.
Visscher, P. T.; Boussagol, P.; Bourillot, R.; Dupraz, C.; Braissant, O.; Decho, A. W.; Burns, B. P.; White III, R. A.; Tomko, P.; Vennin, E. A Critical Role of Heterotrophic Bacteria in Early Diagenesis of Carbonates through Exopolymer Degradation and Calcium Release. Depositional Rec.2026, 12 (1), e70057. https://doi.org/10.1002/dep2.70057.
APPELS A PROPOSITIONS
Appel à projets: AAP3 HARMI
HARMI peut financer 6 projets starters, 3 projets transversaux, 3 projets internationaux et 3 projets industriels.
Propositions à envoyer jusqu’au 9 octobre 2026 à 13h
Détails et conditions sur la page web HARMI
Appel à propositions : Financements de séminaires/workshops/summer schools en 2026
HARMI peut financer 10 séminaires, 3 workshops et 2 summer schools en BFC jusqu’au 1er décembre 2026.
Propositions à envoyer au minimum 2 mois avant l’évènement et au plus tard le 1er octobre 2026.
Détails et conditions sur la page web HARMI
Lauréate de l’AAP séminaires/workshops/summer schools, la plateforme DImaCell organise les 25èmes journées de formation du RIME (summer school)du 1 au 3 juin 2026 à l’INRAE de Dijon sur le thème « Du champ à l’assiette : la microscopie électronique pour imager les artisans de l’invisible, les cellules et les microorganismes ». Programme et inscriptions.
Appel à candidatures : Bourses pour des séjours scientifiques de doctorants/postdoctorants dans des laboratoires étrangers en 2026-2027
HARMI peut financer jusqu’à 5 bourses par an (2000€ maximum).
Propositions à envoyer avant le 1er juin 2026 pour des séjours entre juillet et novembre 2026 ; et avant le 1er octobre 2026 pour des séjours entre décembre 2026 et avril 2027.
Détails et conditions sur la page web HARMI
Toute obtention d’un financement HARMI est conditionnée par un engagement à mentionner dans les publications et les communications scientifiques le soutien et la référence du projet selon l’exemple :
“This research was funded by the HARMI (HARnessing MIcrobiomes for sustainable development) project (ANR-21-EXES-0014) under the France 2030 program managed by the ANR and funded by The European Union NextGenerationEU."
AGENDA HARMI
MAI | |
Deadlines | |
30/05 | Candidatures pour des bourses pour des séjours scientifiques de doctorants/postdoctorants dans des laboratoires étrangers entre juillet et novembre 2026 |
JUIN | |
Evènements | |
1-2-3/06 | Summer school DImaCell / 25èmes journées de formation du RIME « Du champ à l’assiette : la microscopie électronique pour imager les artisans de l’invisible, les cellules et les microorganismes » Lieu : salle de conférence de l’INRAE de Dijon |
4-5/06 | Forum Jeunes Chercheurs, école doctorale « Environnement-Santé » Lieu: Dijon |
18/06 | Lancement du livre HARMI « Le Journal de Chloé: Les microbes, mes nouveaux BFF » Horaire : 11h / Lieu : Biome, Besançon |
SEPTEMBRE | |
Evènements | |
15-16/09 | 3e Symposium HARMI Lieu: Manège de Brack, Dole |
Deadlines | |
30/09 | Candidatures pour des bourses pour des séjours scientifiques de doctorants/postdoctorants dans des laboratoires étrangers entre décembre 2026 et avril 2027 |
| Propositions pour le financement de séminaires/workshops/summer schools en 2026 |
OCTOBRE | |
Deadlines | |
09/10 | Propositions pour le financement de projets dans le cadre de l’AAP3 |
NOUS CONTACTER
Pour toute question, contacter harmi(at)umlp.fr
Page web HARMI https://www.umlp.fr/harmi
Retrouvez-nous sur LinkedIn HARMI-Microbiomes
Le projet HARMI est financé par le programme d’Etat France 2030 géré par l’ANR (référence ANR-21-EXES-0014)
Version française au-dessus
The France 2030 ANR HARMI project launches its newsletter. For this first edition, you will find the current actions, the winners of various fundings and the calls for proposals in progress to support research and training actions in microbiology in Bourgogne Franche-Comté.
HEADLINES
Walls between units are broken down
For the 2nd HARMI call for proposals (AAP2), 14 research projects were selected for funding : 4 starters (DEVINE, FungiTasty, IDYLYK, STREAM), 5 transversal (DERMABIOME, MICROBIOPLAST, MiTasteFly, RESCUE, THIOMINE), 4 international (AMAZ-LIFE, ABRICO, DARWIN, ENVI-FUNGI-R) and 1 industrial (PRO-SIP). These interdisciplinary and inter-units projects (10 BFC units and 3 platforms) cover the 4 HARMI work packages1. Special mention should be made of the work done by the external reviewers and the experts of the International Advisory Board (IAB) in evaluating and ranking the projects.
The 1st call for proposals (AAP1) had funded8 projectsin 2025 : 5 starters (ARMOR, BIORELAX, LALI-HDA, MICMET, PARADE), 1 transversal (IRONEX) et 2 international (FUNGIPSOME, M-CARBO-STORE) that is 8 units et 3 platforms.
1 WP1. Understanding the ecology and the spatio-temporal dynamics of microbial communities; WP2. Deciphering microbiota-host interactions; WP3. Managing microbial communities for enhanced sustainability and service delivery; WP4. Developing microbial biotechnology
Here we go again… the AAP3 HARMI call for proposals is now open ! see the “Calls for Proposals” section
Excellent young researcher.
Maria C. Hernandez-Soriano is the winner of the first HARMIExcellence Research Chair for young researchers “Understanding and steering microbial communities in agroecosystems to enhance the delivery of ecosystem services”. Currently in a postdoc at the John Innes Centre (Norwich, UK), she will be joining the Agroecology Unit (INRAE Dijon) in November 2026.
She came in April to visit the INRAE Dijon and to present her work.
The selection for the 2nd HARMI Chair of Excellence for Young Researchers in UFR Health Science / UMR Chronoenvironnement in Besançon (Antimicrobial Resistance) is in progress.
Two latitudes, two themes.
Ph.D. students Yoann Boisson (Chrono-environnement Unit) and Victor Hugonnot (Biogéosciences Unit) both received a €2,000 HARMI mobility grant to carry out research in a laboratory abroad. Yoann spent three months at the Center for Plant Biotechnology and Genomics in Madrid to study the effect of fungal consortia on poplar trees. Victor, winner of a HARMI half PhD funding2 in 2025, spent two months at the Geological Survey of Norway in Trondheim to study the role of microbial activity in the Earth’s oxygenation using sediment cores.
2as part of the PhD TRACKS program at the TRANSBIO Graduate School
To apply for a mobility grant (doctoral and postdoctoral researchers), see the “Calls for proposals” section
Latest publications
Boussagol, P.; Vennin, E.; Motreuil, S.; Bonnotte, A.; Jouve, G.; Millet, L.; Munier, T.; Visscher, P. T. Enhanced Carbonate Production Model for Temperate Stratified Lakes. Limnol. Oceanogr.2026, 71 (2), e70334. https://doi.org/10.1002/lno.70334.
Visscher, P. T.; Boussagol, P.; Bourillot, R.; Dupraz, C.; Braissant, O.; Decho, A. W.; Burns, B. P.; White III, R. A.; Tomko, P.; Vennin, E. A Critical Role of Heterotrophic Bacteria in Early Diagenesis of Carbonates through Exopolymer Degradation and Calcium Release. Depositional Rec.2026, 12 (1), e70057. https://doi.org/10.1002/dep2.70057.
CALLS FOR PROPOSALS
Call for proposals: AAP3 HARMI
HARMI can fund 6 starter projects, 3 transversal projects, 3 international projects et 3 industrial projects.
Proposals must be submitted by 1:00 p.m. on October 9, 2026
Details and conditions on HARMI webpage
Call for proposals: Funding for seminars/workshops/summer schools in 2026
HARMI can fund 10 seminars, 3 workshops, and 2 summer schools in the BFC region until December 1 2026. Proposals must be submitted at least 2 months before the event and at the latest by October 1 2026.
Details and conditions on HARMI webpage
Winner of the call for proposals for seminars, workshops, and summer schools, the DImaCell platform is organizing the 25th RIME Training Days (summer school)from June 1 to 3, 2026, at INRAE in Dijon, on the theme “From Field to Plate: Electron Microscopy for Imaging the Architects of the Invisible—Cells and Microorganisms ." Program and registration.
Call for Applications: Grants for research stays by PhD students and postdoctoral researchers in foreign laboratories in 2026–2027
HARMI can fund up to five grants per year (maximum €2,000).
Applications must be submitted by June 1 2026, for stays between July and November 2026; and by October 1 2026, for stays between December 2026 and April 2027.
Details and conditions on HARMI webpage
Any HARMI funding is conditional on a commitment to mention in scientific publications and communications the support and reference of the project according to the example: “This research was funded by the HARMI (HARnessing MIcrobiomes for sustainable development) project (ANR-21-EXES-0014) under the France 2030 program managed by the ANR and funded by The European Union NextGenerationEU."
HARMI SCHEDULE
MAY | |
Deadlines | |
30/05 | Applications submission for Grants for research stays for PhD students/postdoctoral researchers in foreign laboratories between July and November 2026 |
JUIN | |
Events | |
1-2-3/06 | DImaCell Summer school / 25th RIME Training Days « From Field to Plate: Electron Microscopy for Imaging the Architects of the Invisible—Cells and Microorganisms » Location : NRAE conference room in Dijon |
4-5/06 | Young Researchers Forum, « Environment - Health » doctoral school, Location: Dijon |
18/06 | Launch of the HARMI book “Chloé’s diary: Microbes, My New BFFs” Time : 11:00 a.m. / Location : Biome, Besançon |
SEPTEMBER | |
Events | |
15-16/09 | HARMI 3rd Symposium Location: Manège de Brack, Dole |
Deadlines | |
30/09 | Applications submission for Grants for research stays for PhD students/postdoctoral researchers in foreign laboratories between December 2026 and April 2027 |
| Proposals submission for funding seminars, workshops, and summer schools in 2026 |
OCTOBER | |
Deadlines | |
09/10 | Proposals submission for project funding under the 3rd call for proposals (AAP3) |
CONTACT US
For any question, contact harmi(at)umlp.fr
HARMI webpage https://www.umlp.fr/harmi
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Le projet HARMI est financé par le programme d’Etat France 2030 géré par l’ANR (référence ANR-21-EXES-0014)
